Anthropic сообщает, что Клод разработал работающие белковые связывающие агенты и обошел человеческих экспертов в некоторых случаях.

      Anthropic сообщает, что его модели Claude разработали работающие белковые связывающие агенты и выполнили химический анализ за считанные минуты. Два эксперимента были опубликованы во вторник. Компания сама сообщила результаты. Она представила их как ранние доказательства того, что Claude может ускорить некоторые этапы разработки лекарств.

      Anthropic поделилась работой на своем исследовательском блоге.

      Основные цифры — это данные самой Anthropic. Claude разработал белковые связывающие агенты против 15 мишеней и добился успеха против 14, сообщила компания. От 22 до 35 процентов его разработок связывались с целевой мишенью, в зависимости от настроек. Anthropic утверждает, что 10-15 процентов — это типичный показатель в данной области сегодня. Некоторые из самых сильных разработок связывались в несколько раз более плотно, чем лучший ранее опубликованный результат, добавила компания.

      Проверки в мокрой лаборатории не проводились внутри компании. Две внешние фирмы, Adaptyv Bio и Twist Bioscience, независимо произвели и протестировали разработки Claude, сообщила Anthropic. Эта физическая валидация — это часть работы с белками, которая все еще занимает недели, независимо от программного обеспечения.

      Связывающий агент — это маленький белок, созданный для того, чтобы плотно прикрепляться к мишени, что является основой работы многих современных лекарств. Проектирование нового связывающего агента с нуля, известное как de novo design, исторически занимало у инженеров белков месяцы на каждую мишень. Эта работа пересекается с более широкой областью открытия лекарств с помощью ИИ.

      Anthropic использовала две модели, Opus 4.8 и предварительный просмотр своей модели Mythos. Она запускала их внутри Claude Science, своей исследовательской рабочей станции. Модели получили длинный запрос, доступ в интернет, соединители и большой пул графических процессоров (GPU). Компания сообщила, что затем оставила модели работать автономно. Claude выбрал, где на каждой мишени связываться, сообщила компания. Он организовал существующие модели проектирования и сворачивания с открытым исходным кодом, а затем отобрал кандидатов.

      Объем вычислений был значительным. Anthropic предоставила моделям до 12,500 часов Nvidia H100 за 48-часовую сессию в одном режиме. Второй режим использовал до 2,500 H100 часов на каждую мишень. Проектирование против одной мишени за раз работало лучше всего, сообщила компания.

      Предварительный просмотр Mythos достиг уровня успеха 35.1 процента таким образом. В целом, кампания произвела 354 подтвержденных связывающих агента из 1,320 разработок.

      Где она преуспела, и где потерпела неудачу

      Некоторые результаты выделялись. Против мишени под названием RBX1 предварительный просмотр Mythos достиг уровня успеха 40 процентов, сообщила Anthropic. Человеческие участники в конкурсе Adaptyv Bio добились 3.7 процента. Лучший дизайн Claude превзошел выигравший проект. Затем была TNFα, белок, который блокируют противовоспалительные препараты, такие как Humira.

      Opus 4.8 разработал связывающие агенты, которые работали на человеческих, обезьяньих и мышиных версиях. Странным образом, предварительный просмотр Mythos не справился с этой мишенью. Anthropic сообщила, что не уверена, почему менее мощная модель преуспела там, где более сильная не смогла.

      Она не сработала повсюду. Против белка, связывающего мальтозу, который является известной «гладкой» мишенью, ни один из 90 дизайнов не был подтвержден как связывающий, сообщила Anthropic. Она добилась лишь скромных результатов против BBF-14, синтетического белка, используемого в качестве жесткого эталона. Компания сообщила, что планирует дальнейшие испытания, чтобы подтвердить свои показатели попаданий и измерения связывания. Она выпустила свои запросы и данные.

      Химический тест использовал публичную модель

      Второй эксперимент использовал Claude Opus 5, самую мощную модель, которую Anthropic предлагает широкой публике. Задачей был химический анализ, рутинная работа по проверке того, что представляет собой соединение и насколько оно чистое. Химики обычно делают это с помощью двух техник, ЯМР и ХРХ, и медленной частью является чтение сырых файлов, которые выдает каждый инструмент.

      Anthropic предоставила Opus 5 только сырые файлы из контрактной лаборатории и двухпредложенный запрос, без программного обеспечения от поставщика и без оператора. Работая внутри Claude Science, модель вернула обработанные результаты за 23 и 19 минут, выполняя два анализа параллельно, сообщила компания. Ее цифры совпали с лабораторными. Чистота составила 96.4 процента против 96.33 процента лаборатории, а количество водорода находилось в пределах округления.

      Два момента стоит отметить. Claude поймал и исправил свою собственную ошибку, сообщила Anthropic, после того как первый проход завысил количество пиков, которые сместились в последующем чтении. И он предложил тот же подтверждающий тест, который лаборатория независимо провела три дня назад. Для файла ХРХ, который пришел в неподдерживаемом формате от поставщика, модель разобралась с кодировкой и проверила свое чтение по собственным итогам инструмента перед анализом чего-либо, сообщила компания.

      Сравнение, которое проводит Anthropic, касается времени. Химик, выполняющий это вручную, тратит примерно 30 минут до часа на образец, а готовый отчет лаборатории по этому образцу пришел через четыре дня после первого измерения. Claude подготовил свой отчет за 25 минут.

      Результаты являются самоотчетными и двойного назначения

      Результаты поступают от Anthropic, о ее собственных моделях. Они не прошли внешнюю рецензию, хотя две внешние лаборатории протестировали белковые связывающие агенты. Компания сообщила, что оценила свои модели «всесторонне» и опубликует больше характеристик, чтобы подтвердить цифры.

      Anthropic также отметила риск в своей собственной работе. Автономное биологическое проектирование является двойного назначения, заявила она: та же способность, которая ускоряет медицину, может помочь злонамеренному лицу создать биологическое оружие.

      По этой причине проектирование белков и другие чувствительные биологические задачи остаются заблокированными на Claude Fable 5, ее самой мощной модели. Вместо этого она создает программу проверенного доступа для ученых. Компания провела собственные тесты на то, насколько далеко ее фильтры для биологического оружия держатся.

      Контекст имеет значение для того, насколько глубоко следует анализировать результаты.

      Собственная публикация Anthropic отмечает, что ИИ движется быстрее всего в таких областях, как математика, где ответ можно быстро проверить. Он движется медленнее в области наук о жизни, где верификация дорогостоящая. Она рассматривает эту работу как основополагающую и говорит, что хочет, чтобы Claude в конечном итоге управлял разработкой лекарств от начала до конца.

      Разработанный связывающий агент, признала она, является лишь первым шагом к настоящему лекарству.